Bom dia Marcelo,
Acho que isso não é possivel, nem mesmo pela API. Dei uma olhada na classes CompanyLocalServiceImpl e não achei nenhum método que pudesse ser utilizado. Do ponto de vista operacional a remoção de uma instância implica em executar um operação em cascata para excluir tudo relacionado à ela, ou seja, qualquer entidade que tenha um campo companyId.
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